Dada la naturaleza multidisciplinaria del programa y la flexibilidad del plan de estudios, de 2005 a la fecha, el programa ha contado con diversos profesores invitados que fortalecen las áreas de especialización. De 14 profesores invitados a impartir algún curso en este periodo, el 57% pertenecen al SNI, el 42% proviene de otras instituciones de educación superior nacionales e internacionales. Algunos de ellos, como el Dr. Dante Avaro Sosa, Dr. Gilberto Conde Zambada y Dr. Jesús Tovar Mendoza han sido profesores invitados de manera cíclica, lo nos ha permitido establecer una relación de cooperación académica que se ve reflejada en codirecciones de tesis, productos académicos y diversos eventos como conferencias y talleres.